2011年1月中旬，卫生局黄红书记及刘锦纷院长一行受邀参加瑞士巴塞尔儿童医院新址落成典礼，两所儿童医院签署合作备忘录并缔结姐妹关系。期间，代表团一行还受到了巴塞尔州副州长兼卫生部长Carlo Conti教授的热情接待。

    上海与巴塞尔于2007年结为姐妹城市，巴塞尔儿童医院建于1846年，是一所集医教研为一体的儿童医院，拥有先进的医疗技术、设备及国际顶尖的专家学者，为瑞士及法国、意大利等周边国家的儿童提供优质的医疗服务。作为两友城之间的实质性交流项目，沈晓明副市长提议上海儿童医学中心与巴塞尔儿童医院建立姐妹医院关系，将两地的合作扩展至儿童医学领域。

    1月14日下午，上海儿童医学中心与巴塞尔儿童医院在巴塞尔州市政厅签署合作备忘录。根据备忘录内容，双方自协议签订之日起将在医疗、教育、研究尤其是转化医学及儿科专家的交流互访等方面开展合作交流，合作平台的建立旨在实现医疗资源共享，进一步发展上海及巴塞尔地区儿童健康医疗服务和项目。巴塞尔州副州长兼卫生部长Carlo Conti教授，巴塞尔儿童医院院长Rita Kohlerman，上海市卫生局党委副书记黄红及儿中心院长刘锦纷等分别发表了热情洋溢的致辞。Carlo Conti教授对于两所优秀的儿童医院的全面合作给予充分的肯定和全力的支持。刘锦纷院长表示，与巴塞尔儿童医院合作备忘录的签订打开了我院与欧洲儿童医院的合作之门，相信双方的精诚合作必将造福两地的儿童健康事业。